Моя логика такова (перепроверьте ещё сами):
Цитата: 1. Налоговая ставка устанавливается в следующих размерах:13 процентов - если сумма налоговых баз, указанных в пункте 2.1 статьи 210 настоящего Кодекса, за налоговый период составляет менее 5 миллионов рублей или равна 5 миллионам рублей;650 тысяч рублей и 15 процентов суммы налоговых баз, указанных в пункте 2.1 статьи 210 настоящего Кодекса, превышающей 5 миллионов рублей, - если сумма налоговых баз, указанных в пункте 2.1 статьи 210 настоящего Кодекса, за налоговый период составляет более 5 миллионов рублей.Налоговая ставка, установленная настоящим пунктом, подлежит применению в отношениисовокупности всех доходовфизического лица - налогового резидента Российской Федерации, подлежащих налогообложению,за исключениемдоходов, облагаемых по налоговым ставкам, предусмотренным пунктами 1.1, 2, 5 и 6 настоящей статьи.
Проверяем исключения (пункты 1.1, 2, 5 и 6 ст. 224 НК РФ) и убеждаемся, что это не наш случай.
Теперь смотрим п. 2.1 ст. 210 НК РФ, к которому нас отсылают в приведённой выше цитате:
Цитата: 2.1.Совокупность налоговых баз, в отношении которой применяетсяналоговая ставка, предусмотренная пунктом 1 статьи 224настоящего Кодекса,включает в себяследующие налоговые базы, каждая из которых определяется в отношении доходов физических лиц - налоговых резидентов Российской Федерации отдельно:1)налоговая база по доходам от долевого участия(в том числе по доходам в виде дивидендов, выплаченных иностранной организации по акциям (долям) российской организации, признанных отраженными налогоплательщиком в налоговой декларации в составе доходов);9) налоговая база по иным доходам, в отношении которых применяется налоговая ставка, предусмотренная пунктом 1 статьи 224 настоящего Кодекса (далее в настоящей главе - основная налоговая база).
Далее переходим к расчёту налога:
Цитата: 1. Сумма налога при применении налоговой ставки, установленной пунктом 1 статьи 224 настоящего Кодекса, исчисляется в следующем порядке:1) если сумма налоговых баз, указанных в пункте 2.1 статьи 210 настоящего Кодекса, составляет менее 5 миллионов рублей или равна 5 миллионам рублей, - как соответствующая налоговой ставке, установленной абзацем вторым пункта 1 статьи 224 настоящего Кодекса, процентная доля указанной суммы налоговых баз;2)если сумма налоговых баз, указанных в пункте 2.1 статьи 210настоящего Кодекса, составляет более 5 миллионов рублей, - как сумма 650 тысяч рублей и величины, равной соответствующей адвалорной налоговой ставке, установленной абзацем третьим пункта 1 статьи 224 настоящего Кодекса, процентной доле уменьшенной на 5 миллионов рублей суммы налоговых баз, указанных в пункте 2.1 статьи 210 настоящего Кодекса;При исчислении суммы налога налогоплательщиком, признаваемым налоговым резидентом Российской Федерации, или налоговым агентом в отношении доходов от долевого участия в организации, полученных в виде дивидендов, положения настоящего пункта применяются с учетом особенностей, установленных пунктами 2 и 3 статьи 214 настоящего Кодекса.
Заглядываем в п. 2 и 3 ст. 214 НК РФ - нет, там речь идёт не о том, что мы здесь сейчас обсуждаем.
Цитата: как тогда трактовать п. 2 ст. 225 - "В отношении физического лица - налогового резидента Российской Федерации общая сумма налога представляет собой сумму, полученную в результате сложения сумм налога, исчисленных в соответствии с пунктами 1, 1.2, 1.3 настоящей статьи и пунктами 2-3.1 статьи 214 настоящего Кодекса".
Пункт 1 ст. 225 мы уже выше посмотрели. Пункты 1.2 и 1.3 к обсуждаемой нами ситуации (ставке налога) отношения не имеют. И статью 214 уже смотрели, но можем вернуться к ней и ещё раз, процитирую (только фрагменты, чтобы короче и нагляднее):
Цитата: 2. Сумма налога в отношениидивидендов, полученныхот источников за пределами Российской Федерации...3. Исчисление суммы и уплата налога в отношении доходовот долевого участия в российской организации, полученныхв виде дивидендов, осуществляются лицом, признаваемым в соответствии с настоящей главойналоговым агентом, отдельно по каждому налогоплательщику применительно к каждой выплате указанных доходов по налоговым ставкам, предусмотренным статьей 224 настоящего Кодекса, с учетом положений пункта 3.1 настоящей статьи.При определении суммы налоганалоговым агентомв соответствии с настоящим пунктом в расчет совокупности налоговых баз для целей применения ставки, указанной в пункте 1 статьи 224 настоящего Кодекса, не включаются налоговые базы, указанные в подпунктах 2-9 пункта 2.1 статьи 210 настоящего Кодекса.
Пп. 3.1 опускаю совсем (там о налоге на прибыль организаций), а в пп. 3 п. 2 ст. 214 НК РФ, как видим, правила установлены исключительно для налоговых агентов.
Вот и получается, что по итогам календарного года ИФНС определяет общий доход ФЛ по совокупности налоговых баз и рассчитывает итоговую сумму налога, применяя к доходу свыше 5 млн руб. (исчисленному в хронологическом порядке) повышенную ставку 15%. И если общая сумма НДФЛ превышает сумму налога, удержанного всеми налоговыми агентами физлица, а также самостоятельно задекларированного им в 3-НДФЛ, то тогда инспекция и присылает уведомление с налогом к доплате - см. п. 6 ст. 228 НК РФ.